MLVA Streptococcus pneumoniae

Génotype

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Affichage des souches similaires (2 marqueurs différents au maximum) ou 

Affichage des génotypes possédant au maximum marqueurs différents

Pour tester l'application, vous pouvez cliquer sur la chaine suivante :  2 2 8 3 9 2 1 2 6 2 1 3 7 1 7 8 1  puis cliquer sur un des boutons Affichage réduit ou Affichage étendu. Vous ne voulez pas prendre en compte un marqueur ? Utilisez le tiret (-).

Autres techniques :     MLST

Phénotype

Sérotype Pour afficher les sérotypes commençant par... saisir le caractère % en fin de chaine. Par exemple 1% affiche 1, 12, 19A...

Epidémiologie

Souche    Site    Centre    Pays    Ville    Commentaire    Année 

         

 Vous pouvez saisir les marqueurs avec comme séparateur indifféremment un espace, ou un des signes suivants  , ; / : _ 

Pour ne pas tester un marqueur, il suffit de remplacer sa valeur par un tiret ( - )

Vous pouvez saisir entre 1 et 17 marqueurs de génotype. La comparaison ne sera effectuée que sur les marqueurs réellement saisis. Les autres marqueurs seront affichés "non testés". Pour ne pas tester un marqueur dans une chaîne, remplacez-le par ND (Non Déterminé).

Pour modifier l'ordre d'affichage, cliquer sur l'en-tête de colonne correspondant au critère de tri sélectionné.

Cet icone permet d'afficher la liste de l'ensemble des valeurs présentes dans la base de données.

Attention : le signe séparateur décimal pour les marqueurs est le point.

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Il y a 60 réponses

Strain_IDCentreCountrySiteYrMLSTSeroPenDiffGéno1234567891011121314151617
RP1279CH LIBOURNEFranceBlood20097F0.016089526820134113320241
RP1291CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.008089526820134113320241
RP1157CHIC MARMANDFranceBlood20097F0.008159126820134112 320241
RP1082CH PAUFranceCSF20097F<0,008159126820134112 320241
RP1172CH PAUFranceBlood20097F0.004159126820134112 320241
RP1053CH DAXFranceBlood20087F159126820134112 320241
RP1063CH ST CYRFranceBlood20097F<0,008159126820134112 320241
RP1065HIA R. PICQUFranceBlood20097F<0,008159126820134112 320241
RP269HIA R. PICQUFranceBlood20067F0.023159126820134112 320241
RP1156CHIC MARMANDFranceCSF20097F0.008159126820134112 320241
RP1079CH PAUFranceBlood20097F<0,008212126820134112 3204 41
RP279CH DAXFranceBlood20077F<0,031212126820134112 3204 41
RP1710CH DAXFranceBlood20117F0.016212126820134112 3204 41
RP1635CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.008212126820134112 3204 41
RP715CHG PAUFranceBlood20077F0.047212126820134112 3204 41
RP1641CHU HAUT LEVFrancePleural li20117F0.016212126820134112 3204 41
RP1286CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.008212126820134112 3204 41
RP1159CH LIBOURNEFranceBlood20097F0.008212126820134112 3204 41
RP1093CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.008212126820134112 3204 41
RP1018CH PAUFranceBlood20077F0.016212126820134112 3204 41
RP1729CH ARCACHONFranceBlood20117F0.016212126820134112 3204 41
RP1577CH DAXFranceBlood20117F0.016212126820134112 3204 41
RP91735CH ARCACHONFranceBlood20117F0.016212126820134112 3204 41
RP1586CHIC MARMANDFranceBlood20117F0.016212126820134112 3204 41
RP1294CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.016212126820134112 3204 41
RP1229CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.004212126820134112 3204 41
RP1762CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.008212126820134112 3204 41
RP154CH MT DE MARFrancePleural li20057F0.03212126820134112 3204 41
RP1593CH LANGONFranceBlood20117F0.016212126820134112 3204 41
RP1259CH PAUFranceBlood20097F0.032212126820134112 3204 41
RP1765CHU HAUT LEVFranceRespirator20117F0.016212126820134112 3204 41
RP1260CH PAUFranceBlood2009190.016212126820134112 3204 41
RP1066CH DAXFranceBlood20097F0.008212126820134112 3204 41
RP1263CH DAXFranceBlood20097F0.008212126820134112 3204 41
RP1118HIA R. PICQUFranceBlood20091<0,004212126820134112 3204 41
RP1067CH DAXFranceBlood20097F0.008212126820134112 3204 41
RP1687CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.016212126820134112 3204 41
RP1630CHU PELLEGRIFrancePleural li20117F0.016212126820134112 3204 41
RP210CH ST CYRFranceBlood20067F0.032216626820134111 3204 41
RP273CH PAUFranceCSF20067F0.0232593267 20134112 320241
RP1097CHU PELLEGRIFranceBlood20097F<0,008277126820134112 3205 41
RP1099CHU PELLEGRIFranceBlood20097F<0,008277226820134112 32010 41
RP1103CHU HAUT LEVFranceExpect20097F0.008277526820134112 3206 41
RP1267CH DAXFranceBlood20097F0.01628872681 0134112 320241
RP1547CH PAUFranceEar pus20107F0.016291226820134112 3299 241
RP1723CH LANGONFranceBlood20117F0.016291226820134112 3299 241
RP1550CH PAUFranceCSF20107F0.016291226820134112 3299 241
RP1642CHU HAUT LEVFranceBlood20117F0.016291226820134112 3299 241
RP1649CH PAUFranceBlood20117F0.008291226820134112 3299 241
RP1314CH PERIGUEUXFranceBlood2009190.016291226820134112 3299 241
RP1685CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.016291226820134112 3299 241
RP1616CHU PELLEGRIFranceEar pus20117F0.016291226820134112 3299 241
RP1319CH ST CYRFranceBlood20107F0.016291226820134112 3299 241
RP1775CH DAXFranceBlood20117F0.016291226820134112 3299 241
RP1686CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.016291226820134112 3299 241
RP1626CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.016291226820134112 3299 241
RP1495HIA R.PICQUEFranceBlood20107F0.008291226820134112 3299 241
RP1819CH PERIGUEUXFranceBlood20117F0.016291226820134112 3299 241
RP1505CHU HAUT LEVFranceBlood20107F0.016291226820134112 3299 241
RP1664CH ST CYRFranceBlood20117F0.01621016268201341133299 22 1

 

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