MLVA Streptococcus pneumoniae

Génotype

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Affichage des souches similaires (2 marqueurs différents au maximum) ou 

Affichage des génotypes possédant au maximum marqueurs différents

Pour tester l'application, vous pouvez cliquer sur la chaine suivante :  2 2 8 3 9 2 1 2 6 2 1 3 7 1 7 8 1  puis cliquer sur un des boutons Affichage réduit ou Affichage étendu. Vous ne voulez pas prendre en compte un marqueur ? Utilisez le tiret (-).

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Sérotype Pour afficher les sérotypes commençant par... saisir le caractère % en fin de chaine. Par exemple 1% affiche 1, 12, 19A...

Epidémiologie

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 Vous pouvez saisir les marqueurs avec comme séparateur indifféremment un espace, ou un des signes suivants  , ; / : _ 

Pour ne pas tester un marqueur, il suffit de remplacer sa valeur par un tiret ( - )

Vous pouvez saisir entre 1 et 17 marqueurs de génotype. La comparaison ne sera effectuée que sur les marqueurs réellement saisis. Les autres marqueurs seront affichés "non testés". Pour ne pas tester un marqueur dans une chaîne, remplacez-le par ND (Non Déterminé).

Pour modifier l'ordre d'affichage, cliquer sur l'en-tête de colonne correspondant au critère de tri sélectionné.

Cet icone permet d'afficher la liste de l'ensemble des valeurs présentes dans la base de données.

Attention : le signe séparateur décimal pour les marqueurs est le point.

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Il y a 21 réponses

Strain_IDCentreCountrySiteYrMLSTSeroPenDiffGéno1234567891011121314151617
RP 119AHIA R. PICQUFranceBronchial 200519F10894107422521216421081
RP98CHU HAUT-LEVFranceCSFND19F0894107422521216421081
RP1010HIA R. PICQUFranceBlood20071410894107422521216421081
RP148CH MARMANDEFranceBlood20051420894107422521216421081
RP119AHIA R. PICQUFranceBronchial 20051410894107422521216421081
RP136CH DAXFranceBlood2005142110541010 422521216421081
RP188CH AGENFranceBlood200514111454107422521216421080
RP206HIA R. PICQUFranceBronchial 2006140.7511624107422521218 421081
RP14CHPAFranceBlood200214<0,0614504107422521215 421081
RP17CHPAFranceBlood200214<0,061453410742252120 6421081
RP1604CHU PELLEGRIFranceBlood20111411453410742252120 6421081
RP1022CH PAUFranceBlood200719F117304107420 521216421081
RP1071CH PAUFranceBlood2009140.2517564107423 521216421081
RP 111HIA R. PICQUFrancePDP200519F0.2528241074222 2121642102 1
RP111HIA R. PICQUFrancePDP2005140.2528241074222 2121642102 1
RP15CHPAFranceBlood200214<0,0624514107422521214 42106 1
1630NMIPolandBAL2003143142268441075 22521210 421081
2487NMIPolandCSF20031431422688410742252122 0 421081
RP1140CH PERIGUEUXFranceBlood2009140.5280745 7422521219 421081
RP1308CH PERIGUEUXFranceBlood2009141290741074225211 164211 81
RP1526CHU PELLEGRIFranceCSF201014129394104 4225212164211 81

 

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