MLVA Streptococcus pneumoniae

Génotype

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Affichage des souches similaires (2 marqueurs différents au maximum) ou 

Affichage des génotypes possédant au maximum marqueurs différents

Pour tester l'application, vous pouvez cliquer sur la chaine suivante :  2 2 8 3 9 2 1 2 6 2 1 3 7 1 7 8 1  puis cliquer sur un des boutons Affichage réduit ou Affichage étendu. Vous ne voulez pas prendre en compte un marqueur ? Utilisez le tiret (-).

Autres techniques :     MLST

Phénotype

Sérotype Pour afficher les sérotypes commençant par... saisir le caractère % en fin de chaine. Par exemple 1% affiche 1, 12, 19A...

Epidémiologie

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 Vous pouvez saisir les marqueurs avec comme séparateur indifféremment un espace, ou un des signes suivants  , ; / : _ 

Pour ne pas tester un marqueur, il suffit de remplacer sa valeur par un tiret ( - )

Vous pouvez saisir entre 1 et 17 marqueurs de génotype. La comparaison ne sera effectuée que sur les marqueurs réellement saisis. Les autres marqueurs seront affichés "non testés". Pour ne pas tester un marqueur dans une chaîne, remplacez-le par ND (Non Déterminé).

Pour modifier l'ordre d'affichage, cliquer sur l'en-tête de colonne correspondant au critère de tri sélectionné.

Cet icone permet d'afficher la liste de l'ensemble des valeurs présentes dans la base de données.

Attention : le signe séparateur décimal pour les marqueurs est le point.

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Il y a 19 réponses

Strain_IDCentreCountrySiteYrMLSTSeroPenDiffGéno1234567891011121314151617
RP1774CHU HAUT LEVFranceRespirator201135B0.250715103825114221320841
RP1141CH PERIGUEUXFranceBlood200935B0.250715103825114221320841
RP1184CHU HAUT LEVFranceBlood200935B0.250715103825114221320841
RP1639CHU PELLEGRIFranceEar pus201135B0.250715103825114221320841
RP1185CHU HAUT LEVFranceExpect200935B0.50715103825114221320841
RP1193CHU HAUT LEVFranceExpect200935B0.250715103825114221320841
RP1289CHU PELLEGRIFranceCSF200935B0.250715103825114221320841
RP1772CHU HAUT LEVFranceRespirator201135B0.50715103825114221320841
RP1060CH PAUFranceBlood200835B17501037 25114221320841
RP1494HIA R.PICQUEFranceBlood201035B0.517501037 25114221320841
RP1643CHU HAUT LEVFranceBlood201135B0.518511038251142213207 41
RP1201CHU HAUT LEVFranceExpect200935B0.2518511038251142213207 41
RP1306CH PERIGUEUXFranceBlood200935B0.519051038251141 21320841
RP1651CH PAUFranceBlood201135B0.51100510382511423 1320841
RP1652CH PAUFranceBlood201135B0.51100611 3825114221320841
RP1701CHU HAUT LEVFranceRespirator201135B0.25110369 3825114221320841
RP1137CH PERIGUEUXFranceBlood200935B0.25280410382511423 13207 41
RP1538HIA R.PICQUEFranceExpect201035B0.5294512 3825113 221320841
RP1540HIA R.PICQUEFranceExpect201035B0.5294711 38251142213207 41

 

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