MLVA Streptococcus pneumoniae

Génotype

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Affichage des souches similaires (2 marqueurs différents au maximum) ou 

Affichage des génotypes possédant au maximum marqueurs différents

Pour tester l'application, vous pouvez cliquer sur la chaine suivante :  2 2 8 3 9 2 1 2 6 2 1 3 7 1 7 8 1  puis cliquer sur un des boutons Affichage réduit ou Affichage étendu. Vous ne voulez pas prendre en compte un marqueur ? Utilisez le tiret (-).

Autres techniques :     MLST

Phénotype

Sérotype Pour afficher les sérotypes commençant par... saisir le caractère % en fin de chaine. Par exemple 1% affiche 1, 12, 19A...

Epidémiologie

Souche    Site    Centre    Pays    Ville    Commentaire    Année 

         

 Vous pouvez saisir les marqueurs avec comme séparateur indifféremment un espace, ou un des signes suivants  , ; / : _ 

Pour ne pas tester un marqueur, il suffit de remplacer sa valeur par un tiret ( - )

Vous pouvez saisir entre 1 et 17 marqueurs de génotype. La comparaison ne sera effectuée que sur les marqueurs réellement saisis. Les autres marqueurs seront affichés "non testés". Pour ne pas tester un marqueur dans une chaîne, remplacez-le par ND (Non Déterminé).

Pour modifier l'ordre d'affichage, cliquer sur l'en-tête de colonne correspondant au critère de tri sélectionné.

Cet icone permet d'afficher la liste de l'ensemble des valeurs présentes dans la base de données.

Attention : le signe séparateur décimal pour les marqueurs est le point.

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Il y a 54 réponses

Strain_IDCentreCountrySiteYrMLSTSeroPenDiffGéno1234567891011121314151617
RP925HIA R. PICQUFranceBlood200710.016068023941613412683532
RP930CH DAXFranceBlood200710.016068023941613412683532
RP931CH DAXFranceBlood200710.125068023941613412683532
RP956CH DAXFranceBlood200710.016068023941613412683532
RP213HIA R. PICQUFranceBlood200610.0471130239411 13412683532
RP166CH AGENFranceBlood200510.0121130239411 13412683532
RP725CH MARMANDEFranceBlood200710.1251130239411 13412683532
RP1721CHU PELLEGRIFranceBlood201110.0161130239411 13412683532
RP204HIA R. PICQUFranceBlood200610.0321130239411 13412683532
RP1778CH DAXFrancePleural li201110.0161130239411 13412683532
RP888CH DAXFranceBlood200710.016167523941613412684 532
RP114HIA R. PICQUFranceBlood200510.03285239411 13412683531.5
RP 114HIA R. PICQUFranceBlood200510.03285239411 13412683531.5
RP731CH MARMANDEFranceBlood200710.0942137239411 1341267 3532
RP1732CH ARCACHONFranceBlood201110.0162137239411 1341267 3532
RP176CH ST CYRFranceBlood200510.0122137239411 1341267 3532
RP1758CHU PELLEGRIFranceBlood201110.0162137239411 1341267 3532
RP957CH ST CYRFranceBlood200710.0162137239411 1341267 3532
RP727CH MARMANDEFranceBlood200710.0642137239411 1341267 3532
RP1760CHU PELLEGRIFrancePleural li201110.0162137239411 1341267 3532
RP728CH MARMANDEFrancePleural li200710.0482137239411 1341267 3532
RP1025CH PAUFranceBlood200710.0162141239411 13412683531
RP1171CH PAUFranceBlood200930610.0042141239411 13412683531
RP1032CH MT DE MARFranceBlood200710.0162141239411 13412683531
RP1601CHU PELLEGRIFranceBlood201110.0162141239411 13412683531
RP1204CHU PELLEGRIFranceBlood200910.0082141239411 13412683531
RP1033CH MT DE MARFranceBlood200710.0162141239411 13412683531
RP1648CH PAUFranceBlood201110.0162141239411 13412683531
RP1226CHU PELLEGRIFranceBlood200910.0082141239411 13412683531
RP1037CH MT DE MARFranceBlood200710.0082141239411 13412683531
RP1676CH LIBOURNEFranceBlood201110.0162141239411 13412683531
RP1228CHU PELLEGRIFranceBlood200910.00182141239411 13412683531
RP1038CH MT DE MARFranceBlood200710.0162141239411 13412683531
RP1299CHU PELLEGRIFranceBlood200910.0162141239411 13412683531
RP1077CH PAUFranceBlood200910.0082141239411 13412683531
RP181CH MARMANDEFranceBlood200510.0122141239411 13412683531
RP1493CH LIBOURNEFranceBlood201010.0162141239411 13412683531
RP1078CH PAUFranceBlood200910.0082141239411 13412683531
RP185CH MARMANDEFranceBlood200510.0122141239411 13412683531
RP1499HIA R.PICQUEFranceBlood201010.0042141239411 13412683531
RP1019CH PAUFranceBlood200730610.0162141239411 13412683531
RP1528CHU PELLEGRIFrancePleural li201010.0042141239411 13412683531
RP271CH PAUFranceBlood200610.042592239411 134122 83532
RP720CHG PAUFranceBlood20070.0642592239411 134122 83532
RP711CHG PAUFranceBlood200710.042614239411 13411 683532
RP716CHG PAUFranceEar pus200710.0322614239411 13411 683532
RP1094CHU PELLEGRIFranceBlood20091<0,0082768239411 134126833 32
RP1716CH MARMANDEFranceBlood201110.01621044239411 135 12683532
RP1717CH MARMANDEFranceBlood201110.01621044239411 135 12683532
RP1738CH LANGONFranceBlood201110.01621049239411 134126832 32
RP1727CH ARCACHONFranceCSF201110.01621049239411 134126832 32
RP1728CH ARCACHONFranceBlood201110.01621050237 411 13412683532
RP1749CH PAUFranceBlood201110.016210622392 11 13412683532
RP1759CHU PELLEGRIFranceBlood201110.016210682393 11 13412683532

 

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