MLVA Streptococcus pneumoniae

Génotype

Entrez la chaine MLVA     ou directement le génotype

Affichage des souches similaires (2 marqueurs différents au maximum) ou 

Affichage des génotypes possédant au maximum marqueurs différents

Pour tester l'application, vous pouvez cliquer sur la chaine suivante :  2 2 8 3 9 2 1 2 6 2 1 3 7 1 7 8 1  puis cliquer sur un des boutons Affichage réduit ou Affichage étendu. Vous ne voulez pas prendre en compte un marqueur ? Utilisez le tiret (-).

Autres techniques :     MLST

Phénotype

Sérotype Pour afficher les sérotypes commençant par... saisir le caractère % en fin de chaine. Par exemple 1% affiche 1, 12, 19A...

Epidémiologie

Souche    Site    Centre    Pays    Ville    Commentaire    Année 

         

 Vous pouvez saisir les marqueurs avec comme séparateur indifféremment un espace, ou un des signes suivants  , ; / : _ 

Pour ne pas tester un marqueur, il suffit de remplacer sa valeur par un tiret ( - )

Vous pouvez saisir entre 1 et 17 marqueurs de génotype. La comparaison ne sera effectuée que sur les marqueurs réellement saisis. Les autres marqueurs seront affichés "non testés". Pour ne pas tester un marqueur dans une chaîne, remplacez-le par ND (Non Déterminé).

Pour modifier l'ordre d'affichage, cliquer sur l'en-tête de colonne correspondant au critère de tri sélectionné.

Cet icone permet d'afficher la liste de l'ensemble des valeurs présentes dans la base de données.

Attention : le signe séparateur décimal pour les marqueurs est le point.

Pour ajouter une souche, vous devez vous dentifier ]   [ Voir tous les génotypes ]    [ Retour accueil ]   

Il y a 103 réponses

Strain_IDCentreCountrySiteYrMLSTSeroPenDiffGéno1234567891011121314151617
RP1075CH PAUFrancePleural li200919A0.125066522839212621471681
RP1233CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.5066522839212621471681
RP775HOPITAL R. France2007330219A183228392126213 71681
RP174CH ST CYRFranceBlood200519A1183228392126213 71681
RP1110CHU PELLEGRIFrancePleural li200919A0.25183228392126213 71681
RP112CH DAXFranceBlood2005NT1183228392126213 71681
RP1509CHU HAUT LEVFranceBlood201019A1183228392126213 71681
RP34HIA PERCYFranceECE200419AI183228392126213 71681
RP 112CH DAXFranceBlood200519A1183228392126213 71681
RP779HOPITAL R. France2007329719A183228392126213 71681
RP276CH DAXFranceBlood200719A0.5183228392126213 71681
RP1236CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.5183228392126213 71681
RP1741CH LANGONFranceBlood201119A1183228392126213 71681
RP770HOPITAL R. France200627619A183228392126213 71681
RP1546CH PAUFranceCSF201019A0.5183228392126213 71681
RP173HIA R. PICQUFranceBlood200519A0.5183228392126213 71681
RP1076CH PAUFranceBlood200923B0.251760228392126214719 81
RP1105CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.251777228392126214718 81
RP1139CH PERIGUEUXFranceBlood200919A118062283921262147166 1
RP1177CH PAUFranceBlood200919A0.2518322283921262147161.5 1
RP1622CHU PELLEGRIFranceBlood201119A0.51995228392126214714 81
RP106CH PERIGUEUXFranceBlood200527619A0.5278228392126213 717 81
RP1215CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.5278228392126213 717 81
RP1625CHU PELLEGRIFranceBlood201119A0.5278228392126213 717 81
RP777HOPITAL R. France200727619A278228392126213 717 81
RP117CH PERIGUEUXFranceBlood20051278228392126213 717 81
RP797HOPITAL R. France199619A278228392126213 717 81
RP 106CH PERIGUEUXFranceBlood200527619A0.5278228392126213 717 81
RP805HOPITAL R. France199819A278228392126213 717 81
RP1296CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.5278228392126213 717 81
RP1165CH LIBOURNEFranceBlood200919A0.25278228392126213 717 81
RP832HOPITAL R. France199727619A278228392126213 717 81
RP278CH DAXFranceBlood200719A0.5278228392126213 717 81
RP 117CH PERIGUEUXFranceBlood200519A1278228392126213 717 81
RP815HOPITAL R. France199627619A278228392126213 717 81
RP1301CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.5278228392126213 717 81
RP837HOPITAL R. France200727619A278228392126213 717 81
RP1268CHU HAUT LEVFranceExpect200981278228392126213 717 81
RP133CH ST CYRFranceEar pus200527619A1278228392126213 717 81
RP1612CHU PELLEGRIFranceEar pus201119A0.5278228392126213 717 81
RP772HOPITAL R. France200627619A278228392126213 717 81
RP1553CH PAUFranceCSF201019A1278228392126213 717 81
RP823HOPITAL R. France200027619A278228392126213 717 81
RP729CH MARMANDEFranceBlood200719A1.5278228392126213 717 81
RP132CH PERIGUEUXFranceBlood200519A0.52102228392127 213 71681
RP1290CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.52136228392126213 714 81
RP175HIA R. PICQUFranceEar pus200519A12136228392126213 714 81
RP1734CH ARCACHONFranceBlood201119A12136228392126213 714 81
RP1235CHU PELLEGRIFranceEar pus200919A0.52136228392126213 714 81
RP836HOPITAL R. France200527619A2136228392126213 714 81
RP1298CHU PELLEGRIFranceEar pus200919A0.52136228392126213 714 81
RP709CHG PAUFranceEar pus200719A22136228392126213 714 81
RP1766CHU HAUT LEVFranceRespirator201119A22136228392126213 714 81
RP1700CHU HAUT LEVFranceRespirator201119A0.52136228392126213 714 81
RP1599CHU PELLEGRIFranceCSF201119A0.52136228392126213 714 81
RP767HOPITAL R. France200427619A2490228392126213 719 81
RP776HOPITAL R. France200727619A2490228392126213 719 81
RP1089CHU PELLEGRIFranceCSF200919A0.1252490228392126213 719 81
RP1527CHU PELLEGRIFranceBlood201019A12490228392126213 719 81
RP1529CHU PELLEGRIFranceBlood201019A12490228392126213 719 81
RP1237CHU PELLEGRIFranceCSF200919A0.52490228392126213 719 81
RP1211CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.0322490228392126213 719 81
RP1083CH PAUFranceBlood200919A0.1252493228392126213 715 81
RP1295CHU PELLEGRIFranceBlood200919A12493228392126213 715 81
RP1234CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.252493228392126213 715 81
RP1568HIA R.PICQUEFranceBlood201119A0.52493228392126213 715 81
RP835HOPITAL R. France200527619A2493228392126213 715 81
RP1098CHU HAUT LEVFranceBlood200919A0.52493228392126213 715 81
RP771HOPITAL R. France200627619A2493228392126213 715 81
RP817HOPITAL R. France199627619A2493228392126213 715 81
RP1768CHU HAUT LEVFranceRespirator201119A12493228392126213 715 81
RP1100CHU PELLEGRIFranceBlood200919A0.1252493228392126213 715 81
RP1068CH DAXFranceBlood200919A0.52493228392126213 715 81
RP1281CH LIBOURNEFranceBlood200919A0.52529228392126213 7169 1
RP1508CHU HAUT LEVFranceBlood201019A0.52529228392126213 7169 1
RP824HOPITAL R. France200727619A2529228392126213 7169 1
RP1498HIA R.PICQUEFranceBlood201019A0.52530228392126213 713 81
RP1036CH MT DE MARFranceBlood200719A12530228392126213 713 81
RP1731CHU PELLEGRIFranceBlood201119A0.52530228392126213 713 81
RP825HOPITAL R. France2007267419A2530228392126213 713 81
RP1578CH DAXFranceCSF201119A12530228392126213 713 81
RP1304CHIC MARMANDFranceEar pus200919A0.52530228392126213 713 81
RP834HOPITAL R. France200527619A2536228392126213 712 81
RP833HOPITAL R. France200527619A2536228392126213 712 81
RP1711CH DAXFranceBlood201119A12615228392126213 718 81
RP730CH MARMANDEFranceBlood200719A1.52615228392126213 718 81
RP1713CH DAXFranceBlood201119A12615228392126213 718 81
RP1631CHU PELLEGRIFranceEar pus201119A0.1252615228392126213 718 81
RP1144CHIC MARMANDFranceBlood200919A0.52615228392126213 718 81
RP1675CH LIBOURNEFranceBlood201119A12615228392126213 718 81
RP1520CHU HAUT LEVFranceExpect201019A0.52615228392126213 718 81
RP1092CHU PELLEGRIFranceEar pus200919A0.1252615228392126213 718 81
RP1167CH LIBOURNEFranceBlood200919A0.252615228392126213 718 81
RP713CHG PAUFranceBlood200719A0.52615228392126213 718 81
RP1703CHU HAUT LEVFranceRespirator201119A12615228392126213 718 81
RP1316CH PERIGUEUXFranceHip punctu200919A22615228392126213 718 81
RP1278CH LIBOURNEFranceBlood200919A12615228392126213 718 81
RP1820CH PERIGUEUXFranceBlood201119A0.52657228392126213 7110 81
RP1095CHU PELLEGRIFranceCSF200919A0.252769228392126213 7167 1
RP1573CH AGENFranceBlood201119A0.529662283921263 13 71681
RP1683CHU PELLEGRIFranceBlood2011240.52102622839213 2 21471681
RP1696CHU HAUT LEVFranceRespirator201119A121033228392128 214715 81
RP1736CH ARCACHONFranceBlood201119A0.521053228392123 213 71681

 

Pour ajouter une souche, vous devez vous dentifier ]   [ Voir tous les génotypes ]    [ Retour accueil ]