MLVA Streptococcus pneumoniae

Génotype

Entrez la chaine MLVA     ou directement le génotype

Affichage des souches similaires (2 marqueurs différents au maximum) ou 

Affichage des génotypes possédant au maximum marqueurs différents

Pour tester l'application, vous pouvez cliquer sur la chaine suivante :  2 2 8 3 9 2 1 2 6 2 1 3 7 1 7 8 1  puis cliquer sur un des boutons Affichage réduit ou Affichage étendu. Vous ne voulez pas prendre en compte un marqueur ? Utilisez le tiret (-).

Autres techniques :     MLST

Phénotype

Sérotype Pour afficher les sérotypes commençant par... saisir le caractère % en fin de chaine. Par exemple 1% affiche 1, 12, 19A...

Epidémiologie

Souche    Site    Centre    Pays    Ville    Commentaire    Année 

         

 Vous pouvez saisir les marqueurs avec comme séparateur indifféremment un espace, ou un des signes suivants  , ; / : _ 

Pour ne pas tester un marqueur, il suffit de remplacer sa valeur par un tiret ( - )

Vous pouvez saisir entre 1 et 17 marqueurs de génotype. La comparaison ne sera effectuée que sur les marqueurs réellement saisis. Les autres marqueurs seront affichés "non testés". Pour ne pas tester un marqueur dans une chaîne, remplacez-le par ND (Non Déterminé).

Pour modifier l'ordre d'affichage, cliquer sur l'en-tête de colonne correspondant au critère de tri sélectionné.

Cet icone permet d'afficher la liste de l'ensemble des valeurs présentes dans la base de données.

Attention : le signe séparateur décimal pour les marqueurs est le point.

Pour ajouter une souche, vous devez vous dentifier ]   [ Voir tous les génotypes ]    [ Retour accueil ]   

Il y a 58 réponses

Strain_IDCentreCountrySiteYrMLSTSeroPenDiffGéno1234567891011121314151617
RP210CH ST CYRFranceBlood20067F0.032016626820134111320441
RP1765CHU HAUT LEVFranceRespirator20117F0.016112126820134112 320441
RP1635CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.008112126820134112 320441
RP1260CH PAUFranceBlood2009190.016112126820134112 320441
RP1159CH LIBOURNEFranceBlood20097F0.008112126820134112 320441
RP154CH MT DE MARFrancePleural li20057F0.03112126820134112 320441
RP1641CHU HAUT LEVFrancePleural li20117F0.016112126820134112 320441
RP1093CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.008112126820134112 320441
RP1263CH DAXFranceBlood20097F0.008112126820134112 320441
RP1687CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.016112126820134112 320441
RP1577CH DAXFranceBlood20117F0.016112126820134112 320441
RP1066CH DAXFranceBlood20097F0.008112126820134112 320441
RP1710CH DAXFranceBlood20117F0.016112126820134112 320441
RP1586CHIC MARMANDFranceBlood20117F0.016112126820134112 320441
RP1286CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.008112126820134112 320441
RP1229CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.004112126820134112 320441
RP1067CH DAXFranceBlood20097F0.008112126820134112 320441
RP279CH DAXFranceBlood20077F<0,031112126820134112 320441
RP1729CH ARCACHONFranceBlood20117F0.016112126820134112 320441
RP1593CH LANGONFranceBlood20117F0.016112126820134112 320441
RP1118HIA R. PICQUFranceBlood20091<0,004112126820134112 320441
RP715CHG PAUFranceBlood20077F0.047112126820134112 320441
RP91735CH ARCACHONFranceBlood20117F0.016112126820134112 320441
RP1630CHU PELLEGRIFrancePleural li20117F0.016112126820134112 320441
RP1294CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.016112126820134112 320441
RP1079CH PAUFranceBlood20097F<0,008112126820134112 320441
RP1018CH PAUFranceBlood20077F0.016112126820134112 320441
RP1762CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.008112126820134112 320441
RP1259CH PAUFranceBlood20097F0.032112126820134112 320441
RP1070HIA R. PICQUFranceExpect20097F<0,00817552682013411130 0441
RP121CH DAXFranceBlood20057A0.032912682013410 2 320441
RP 121CH DAXFranceBlood200570.032912682013410 2 320441
RP141ACH BERGERACFranceBlood20057F0.03211027 820134112 320441
RP1555CHU HAUT LEVFranceBlood20107F0.008211027 820134112 320441
RP1262CH LANGONFranceBlood20097F0.016211027 820134112 320441
RP178CH DAXFranceBlood20057F0.03211027 820134112 320441
RP1173CH PAUFranceBlood20097F0.008211027 820134112 320441
RP1252CH PAUFranceBlood20097F0.008211027 820134112 320441
RP1258CH PAUFranceBlood20097F0.016211027 820134112 320441
RP1053CH DAXFranceBlood20087F259126820134112 3202 41
RP1172CH PAUFranceBlood20097F0.004259126820134112 3202 41
RP1063CH ST CYRFranceBlood20097F<0,008259126820134112 3202 41
RP1065HIA R. PICQUFranceBlood20097F<0,008259126820134112 3202 41
RP269HIA R. PICQUFranceBlood20067F0.023259126820134112 3202 41
RP1156CHIC MARMANDFranceCSF20097F0.008259126820134112 3202 41
RP1157CHIC MARMANDFranceBlood20097F0.008259126820134112 3202 41
RP1082CH PAUFranceCSF20097F<0,008259126820134112 3202 41
RP1088CHU PELLEGRIFranceBlood20097F<0,008276526820135 112 320441
RP1097CHU PELLEGRIFranceBlood20097F<0,008277126820134112 3205 41
RP1099CHU PELLEGRIFranceBlood20097F<0,008277226820134112 32010 41
RP1103CHU HAUT LEVFranceExpect20097F0.008277526820134112 3206 41
RP1174CH PAUFrancePleural li20097F0.008283026820134112 323 441
RP1279CH LIBOURNEFranceBlood20097F0.016289526820134113 3202 41
RP1291CHU PELLEGRIFranceBlood20097F0.008289526820134113 3202 41
RP1300CHU PELLEGRIFrancePleural li20097F0.00829032682015 4112 320441
RP1570CH AGENFranceBlood20117F0.016296426820134112 399 0441
RP1633CHU PELLEGRIFranceBlood20117F0.008299926820134112 32042 1
RP1658CH PAUFranceBlood20117F0.0162101226820134112 32046 1

 

Pour ajouter une souche, vous devez vous dentifier ]   [ Voir tous les génotypes ]    [ Retour accueil ]