MLVA Streptococcus pneumoniae

Génotype

Entrez la chaine MLVA     ou directement le génotype

Affichage des souches similaires (2 marqueurs différents au maximum) ou 

Affichage des génotypes possédant au maximum marqueurs différents

Pour tester l'application, vous pouvez cliquer sur la chaine suivante :  2 2 8 3 9 2 1 2 6 2 1 3 7 1 7 8 1  puis cliquer sur un des boutons Affichage réduit ou Affichage étendu. Vous ne voulez pas prendre en compte un marqueur ? Utilisez le tiret (-).

Autres techniques :     MLST

Phénotype

Sérotype Pour afficher les sérotypes commençant par... saisir le caractère % en fin de chaine. Par exemple 1% affiche 1, 12, 19A...

Epidémiologie

Souche    Site    Centre    Pays    Ville    Commentaire    Année 

         

 Vous pouvez saisir les marqueurs avec comme séparateur indifféremment un espace, ou un des signes suivants  , ; / : _ 

Pour ne pas tester un marqueur, il suffit de remplacer sa valeur par un tiret ( - )

Vous pouvez saisir entre 1 et 17 marqueurs de génotype. La comparaison ne sera effectuée que sur les marqueurs réellement saisis. Les autres marqueurs seront affichés "non testés". Pour ne pas tester un marqueur dans une chaîne, remplacez-le par ND (Non Déterminé).

Pour modifier l'ordre d'affichage, cliquer sur l'en-tête de colonne correspondant au critère de tri sélectionné.

Cet icone permet d'afficher la liste de l'ensemble des valeurs présentes dans la base de données.

Attention : le signe séparateur décimal pour les marqueurs est le point.

Pour ajouter une souche, vous devez vous dentifier ]   [ Voir tous les génotypes ]    [ Retour accueil ]   

Il y a 45 réponses

Strain_IDCentreCountrySiteYrMLSTSeroPenDiffGéno1234567891011121314151617
RP179CH DAXFranceEar pus200510.012013923941113412283531
RP1037CH MT DE MARFranceBlood200710.0081141239411134126 83531
RP1299CHU PELLEGRIFranceBlood200910.0161141239411134126 83531
RP1171CH PAUFranceBlood200930610.0041141239411134126 83531
RP1038CH MT DE MARFranceBlood200710.0161141239411134126 83531
RP1601CHU PELLEGRIFranceBlood201110.0161141239411134126 83531
RP1648CH PAUFranceBlood201110.0161141239411134126 83531
RP1493CH LIBOURNEFranceBlood201010.0161141239411134126 83531
RP1676CH LIBOURNEFranceBlood201110.0161141239411134126 83531
RP1499HIA R.PICQUEFranceBlood201010.0041141239411134126 83531
RP1204CHU PELLEGRIFranceBlood200910.0081141239411134126 83531
RP1077CH PAUFranceBlood200910.0081141239411134126 83531
RP1019CH PAUFranceBlood200730610.0161141239411134126 83531
RP1226CHU PELLEGRIFranceBlood200910.0081141239411134126 83531
RP1078CH PAUFranceBlood200910.0081141239411134126 83531
RP1025CH PAUFranceBlood200710.0161141239411134126 83531
RP181CH MARMANDEFranceBlood200510.0121141239411134126 83531
RP1528CHU PELLEGRIFrancePleural li201010.0041141239411134126 83531
RP1228CHU PELLEGRIFranceBlood200910.00181141239411134126 83531
RP1032CH MT DE MARFranceBlood200710.0161141239411134126 83531
RP185CH MARMANDEFranceBlood200510.0121141239411134126 83531
RP1033CH MT DE MARFranceBlood200710.0161141239411134126 83531
RP271CH PAUFranceBlood200610.04159223941113412283532
RP720CHG PAUFranceBlood20070.064159223941113412283532
RP1535CHU PELLEGRIFranceCSF201010.0081943239411134127 83531
RP114HIA R. PICQUFranceBlood200510.03285239411134126 83531.5
RP 114HIA R. PICQUFranceBlood200510.03285239411134126 83531.5
RP213HIA R. PICQUFranceBlood200610.0472130239411134126 83532
RP725CH MARMANDEFranceBlood200710.1252130239411134126 83532
RP166CH AGENFranceBlood200510.0122130239411134126 83532
RP1721CHU PELLEGRIFranceBlood201110.0162130239411134126 83532
RP1778CH DAXFrancePleural li201110.0162130239411134126 83532
RP204HIA R. PICQUFranceBlood200610.0322130239411134126 83532
RP1052CH DAXFranceBlood2008127442393 11134126 83531
RP1558HIA R.PICQUEFranceBlood201110.01627442393 11134126 83531
RP1062CH ST CYRFranceBlood200910.00827522392 11134126 83531
RP1154CHIC MARMANDFranceBlood200910.008281923941113413 6 83531
RP1257CH PAUFranceBlood200910.0082822239411134126 7 3531
RP1175CH PAUFranceBlood200910.0082822239411134126 7 3531
RP1160CH LIBOURNEFranceBlood200910.0082822239411134126 7 3531
RP1162CH LIBOURNEFranceBlood200910.00828242395 11134126 83531
RP1504CHU HAUT LEVFranceExpect201010.00828242395 11134126 83531
RP1250CH LANGONFranceBlood200910.00828242395 11134126 83531
RP1180HIA R. PICQUFranceBlood200910.008283523941113411 6 83531
RP1684CHU PELLEGRIFranceBlood201110.01621027239411134126 832 31

 

Pour ajouter une souche, vous devez vous dentifier ]   [ Voir tous les génotypes ]    [ Retour accueil ]