MLVA Streptococcus pneumoniae

Génotype

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Affichage des souches similaires (2 marqueurs différents au maximum) ou 

Affichage des génotypes possédant au maximum marqueurs différents

Pour tester l'application, vous pouvez cliquer sur la chaine suivante :  2 2 8 3 9 2 1 2 6 2 1 3 7 1 7 8 1  puis cliquer sur un des boutons Affichage réduit ou Affichage étendu. Vous ne voulez pas prendre en compte un marqueur ? Utilisez le tiret (-).

Autres techniques :     MLST

Phénotype

Sérotype Pour afficher les sérotypes commençant par... saisir le caractère % en fin de chaine. Par exemple 1% affiche 1, 12, 19A...

Epidémiologie

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 Vous pouvez saisir les marqueurs avec comme séparateur indifféremment un espace, ou un des signes suivants  , ; / : _ 

Pour ne pas tester un marqueur, il suffit de remplacer sa valeur par un tiret ( - )

Vous pouvez saisir entre 1 et 17 marqueurs de génotype. La comparaison ne sera effectuée que sur les marqueurs réellement saisis. Les autres marqueurs seront affichés "non testés". Pour ne pas tester un marqueur dans une chaîne, remplacez-le par ND (Non Déterminé).

Pour modifier l'ordre d'affichage, cliquer sur l'en-tête de colonne correspondant au critère de tri sélectionné.

Cet icone permet d'afficher la liste de l'ensemble des valeurs présentes dans la base de données.

Attention : le signe séparateur décimal pour les marqueurs est le point.

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Il y a 12 réponses

Strain_IDCentreCountrySiteYrMLSTSeroPenDiffGéno1234567891011121314151617
RP1661HIA R.PICQUEFranceBlood201133F0.0160118248163102611430531
RP150CH MARMANDEFranceBlood20050.030118248163102611430531
RP1557HIA R.PICQUEFranceBlood201133F0.008195624816311 2611430531
RP1594HIA R.PICQUEFranceBlood201133F0.00819762481638 2611430531
RP1595HIA R.PICQUEFranceBlood201133F0.00819762481638 2611430531
RP1670CH ST CYRFranceCSF201133F0.01619762481638 2611430531
RP1194CHU HAUT LEVFranceExpect20096B0.0322ND2481638 2611430ND31
RP1284CHIC MARMANDFranceBlood2009180.0082898247 1634 2611430531
RP1311CH PERIGUEUXFranceCSF2009120.01629102481639 26115 30531
RP1704CHU HAUT LEVFranceRespirator201133F0.008210382481638 21 11430531
RP1739CH LANGONFranceBlood201133F0.0082105424813 37 2611430531
RP1805CH PERIGUEUXFranceBlood201133F0.01621078248162 9 2611430531

 

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